Se passa décadas depois do fim de Yu-Gi-Oh GX. Yu-Gi-Oh! 5D's mostra que os duelos avançaram bastante, ganhando um novo aspecto, sendo chamados de Riding Duels, sendo jogados em grandes estádios, e os duelistas andam em D-Wheels (um tipo de motocicleta), duelando neles. Mas esses duelos especiais são mais difíceis que os normais, como não poder usar cartas mágicas normais, e sim as Speed Spells, que são usadas de acordo com os Speed Counters do jogador. A cidade mudou muito também, ficou mais futurística, sendo chamada de Neo Domino City, guiada pelo Rex Godwin, seu líder. A história começa quando Yusei Fudo tem seu D-Wheel e sua carta Stardust Dragon roubados pelo seu rival Jack Atlus. Ele vai atrás de Jack para recuperá-los saindo da sua cidade Satellite, que é a parte pobre de Neo Domino City.Lista de Episódios Online:
Episódio 01 - Duelo sobre Rodas! Aceleração!
Episódio 02 - Baralho de Poderosos Insetos! A armadilha de AntLion
Episódio 03 - Escape! Nitro Warrior VS Goyou Guardia
Episódio 04 - Encontro Inevitavel! Stardust Dragon no caminho!
Episódio 05 - A luta dos Áses Dragões! Stardust contra Red Demon's!
Episódio 06 - Olhe! Meu baralho do tesouro escondido!
Episódio 07 - O coração das cartas! Crystal Skull contra Great Bull Ogre!
Episódio 08 - A alma perturbada: Signatários e dragão lendario!
Episódio 09 - Sentimentos Inclinados as cartas: Uma partida mortal...(Parte 1)
Episódio 10 - Sentimentos Inclinados as cartas: Uma partida mortal...(Parte 2)
Episódio 11 - O baralho especial de perseguição retorna!
Episódio 12 - Perseguição sem Fim! Costure os Laços, Turbo Warrior
Episódio 13 - Ligue-se! Rugido o baralho deformador
Episódio 14 - O floclore resplandece! O enviado da destruição, Black Rose Witsh!
Episódio 15 - O duelo do torneio do destino tem inicio!
Episódio 16 - O retorno da bruxa! O dragão da destruição, Black Rose Dragon!
Episódio 17 - O vingador da chama! Rei da Velocidade, Caveira de Fogo!
Episódio 18 - A floresta Anciã! Convite ao mundo dos espiritos
Episódio 19 - O mundo dos espiritos contaminado!
Episódio 20 - Sentimentos comprometidos!
Episódio 21 - O Bommer Vingador! Armadilha da Dor, Chariot Pile
Episódio 22 - Passado revelado! O professor duelista contra Black Rose Witch
Episódio 23 - Duelo Final! Coração escondido por traz da Mascara
Episodio 24 - Vitima do Santuario ! Torne-se estrela destruidora ! Stardust Dragon
Episódio 25 - Final do Torneio do Destino ! O rei solitário, Jack Atlus
Episodio 26 - O destino dos Signatários ! O futuro guiado pelo Dragão Vermelho!
Episódio 27 - Um mundo sem luz ! Synchro das Trevas, Freezing Fitzgerald
Episódio 28 - Trevas que consomen tudo: O imortal Signatario das trevas
Episódio 29 - Uma Ameaça Iminente: Signatário das Trevas Ushio?
Episódio 30 - Meu Nome é Crow! Voe, Black Bird
Episódio 31 - Terra Natal e Amigos: Juntos em um Tag Riding
Episódio 32 - Símbolo da Liberdade, Ponte Daedalus
Episódio 33 - Inferno Vingativo: Antigo Amigo, Kiryu Kyosuke
Episódio 34 - Synchro das Trevas! Apareça One-Hundred Eyes Dragon
Episódio 35 - Aterrorizador! Earthbound God, Ccapac Apu
Episódio 36 - Unindo Coragem com Força! Invocação Synchro!
Episódio 37 - Infiltrar! Movimento Arcadia, é o meu turno!
Episódio 38 - Alma Ressucitada! Novo Geoglifo em Chamas!
Episódio 39 - Desça! Os 2 Earthbound Gods
Episódio 40 - Passado Irreversível: Um Coração de Portas Fechadas!
Episódio 41 - Ódio Causado pela Dor! Pegue-o Stardust Dragon!
Episódio 42 - Reunam-se! Guerreiros do Dragão Vermelho
Episódio 43 - Decisão de Cada Um! Aquilo em que acreditamos de Todo Coração!
Episódio 44 - Agite os Ventos Divinos! Black Feather Arms Wing
Episódio 45 - Confronto! O Homem Com a Marca da Aranha!
Episódio 46 - A Verdade de 17 Anos Atrás. A Armadilha Escondida
Episódio 47 - O Homem com a Marca do Geoglifo do Macaco!
Episódio 48 - Mundo Negativo! Procure Pelo Leão Branco Regulus!
Episódio 49 - O rei que domina o negativo! O rei macaco demoniaco
Episódio 50 - Maldição negativa! O capturado Ancient Fairy Dragon
Episódio 51 - Ressuscite ! Riding Duel ultrapassando os limites.
Episódio 52 - No final as emoções tecidas pelas cartas
Episódio 53 - Rajadas de vento feroz. Black Feather - Lone Silver Wind
Episódio 54 - O Ultimo Duelo do Grupo Satisfaction
Episódio 55 - O sentimento dos companheiros. Dragão da Salvação, Savior Dragon
Episódio 56 - A promessa de 17 anos atrás. O destino guiado pelo Momentum
Episódio 57 - Escuridão no coração. A última esperança restante
Episódio 58 - Destino a frente ! Grande governante do inferno. Rei das Trevas.
Episódio 59 - A luz solitária. Savior Demon Dragon
Episódio 60 - História Triste. Memórias Dolorosas.
Episódio 61 - No final da verdade
Episódio 62 - A batalha final ! O homem que possue 2 Deuses.
Episódio 63 - O mais poderoso Earthbound God ! Wiraqocha Rasca !
Episódio 64 - Para nosso futuro
Episódio 65 - Uma nova ameaça
Episódio 66 - Simbolo da Evolução, Synchro Monster.
Episódio 67 - Tradição da Academia de duelos: Antiga engrenagem
Episódio 68 - Memórias de um Ancião: O Deck da família Scrap-Metal.
Episódio 69 - Uma ameaça ! Ficha de Empréstimos Infernal
Episódio 70 - A Floresta dos Espíritos Distantes - Bela Adormecida.
Episódio 71 - Yusei Capturado.
Episódio 72 - O que está dentro do vento
Episódio 73 - Após A Selagem Da Invocação Synchro...
Episódio 74 - Evolução Avançada! Accel Synchro.
Episódio 75 - Aki Izayoi Aceleration!
Episódio 76 - O orgulho, Archfiend Chaos King.
Episódio 77 - Ai vem ! O super estudante de elite.
Episódio 78 - Um pesadelo renasce ! Machine Emperor Skiel
Episódio 79 - Para um mundo ainda não visto
Episódio 80 - O misterioso super mecânico
Episódio 81 - Operação: Captura do Jeager!
Episódio 82 - Yusei Fudo: Chances de Derrota 100%
Episódio 83 - Um suspeito!? Jack Atlus
Episódio 84 - O outro Jack
Episódio 85 - Relógio Cuco
Episódio 86 - Crash Town
Episódio 87 - Salve Kiryu ! A cidade dos duelistas andarilhos
Episódio 88 - A armadilha colocada na frente da vitória
Episódio 89 - O terrivel Gatling Ogre
Episódio 90 - Riding Duel até a morte!
Episódio 91 - Tag Duel: Kiryu e Yusei vs Lotten
Episódio 92 - Satisfaction
Episódio 93 - Tema de Medo ! A determinação do mestre e do servo!
Episódio 94 - Lembranças: Confiado com o desejo de morrer de um amigo
Episódio 95 - Voe ! Blackfeather Dragon !
Episódio 96 - Reuna-se ! Time 5D's
Episódio 97 - Depois de desespero e conflito ...
Episódio 98 - O WRGP Começa ! Time 5D's VS Time Unicorn
Episódio 99 - Quime ! Phoenixian Cluster Amaryllis
Episódio 100 - Situação dificil!O ultimo corredor Yusei
Episódio 101 - Pelo Time
Episódio 102 - Apenas Pela Vitória
Episódio 103 - O Que Foi Ganho Após a batalha?
Episódio 104 - Os Enviados da Destruição
Episódio 105 - Carta das Trevas - Hidden Knight - Hook
Episódio 106 - O Exército de Ghosts!O Terrível Modo Battle Royal
Episódio 107 - Acorde!Ponto te Vista Decidido - Clear Mind
Episódio 108 - O Medo Revivido - Machine Emperor Wisel
Episódio 109 - Accel Synchro ! Nasça ! Shooting Star Dragon !
Episódio 110 - Os Três Imperadores de Yliaster
Episódio 111 - Para as Terras Antigas de Nazca
Episódio 112 - O Demônio Vermelho
Episódio 113 - Alma Fervente!Scar-Red Nova Dragon
Episódio 114 - Operação Captura do Yeager 2
Episódio 115 - Aproxime-se do Mistério!O Riding Duel Definitivo
Episódio 116 - O Exército de Ghosts!O Terrível Modo Battle Royal
Episódio 117 - Acorde!Ponto te vista decidido - Clear Mind
Episódio 118 - Os Novos Rivais
Episódio 119 - Os Monstros Invenciveis! Quebre a Defesa Indestrutivel!
Episódio 120 - Arcredite Nesses Sentimentos!Holding-Hands Majine
Episódio 121 - A Milagrosa Carta da Vitória - Sleeping Giant Zushin
Episódio 122 - Acredite no Poder!O Poderoso Giant Zushin Vs Shooting Star Dragon
Episódio 123 - Os Duelistas com Olhos Rúnicos
Episódio 124 - Orgulho Ferido
Episódio 125 - Luta de Almas! Polar God King Thor Vs Scar-Red Nova Dragon
Episódio 126 - Desça! O Segundo Deus - Polar God King Loki
Episódio 127 - Luta Feroz! Correndo Para o Destino dos Blackwings!
Episódio 128 - Os Três Deuses Polares Imortais! Ruja, Majestic Star Dragon!
Episódio 129 - Gjallahorn! Contagem Ragressiva Para o Fim
Episódio 130 - Salto Para o Futuro! Vínculos Com Nossos Amigos
Episódio 131 - A Batalha Para Decidir o Futuro!
Episódio 132 - Luta Intensa! Machine Emperor Wisel
Episódio 133 - O Terrível Imperador Gigante! Machine Emperor Grannel
Episódio 134 - O Caminho Para A Derrota! O Futuro Guiado Pela Invocação Synchro
Episódio 135 - O Demônio Que Causa Desespero!
Episódio 136 - Uma Batalha De Vencer Ou Morrer!
Episódio 137 - Um Terror Se Aproxima! Ark Cradle, A Cidade Do Deus
Episódio 138 - O Caminho Para o Futuro A Ponte Do Arco-Íris Bifrost
Episódio 139 - Campo Encantado! Ecole De Zone
Episódio 140 - The Soul-Binding Gate! O Futuro Proibido!
Episódio 141 - Duelo De Desespero! Fortíssimo The Moving Fortress!
Episódio 142 - Uma Batalha De Vida Ouu Morte!
Episódio 143 - O Milagre Da Vida! Life Stream Dragon!!
Episódio 144 - O Começo do fim! Uma luta para o futuro!
Episódio 145 - Mais Rápido que a Luz
Episódio 146 - O Último Humano: ZONE
Episódio 147 - Uma Esperança para o Futuro!
Episódio 148 - Uma Chance de Girar Isso Tudo ao redor
Episódio 149 - Um Herói Revivido
Episódio 150 - Sentimentos Confiados Pelo Meu Pai
